ภาวะหยุดหายใจขณะทำให้หัวใจตึงเครียด เนื่องจากต้องเร่งสูบฉีดเลือดให้เร็วขึ้นเพื่อชดเชยการขาดออกซิเจน ระดับออกซิเจนที่ผันผวนยังทำให้เกิดคราบพลัคในหลอดเลือดแดง เพิ่มความเสี่ยงต่อโรคหัวใจและหลอดเลือด ความดันโลหิตสูง และโรคหลอดเลือดสมอง ในช่วงกลางทศวรรษ 1990 หยุดหายใจ คณะกรรมการวิจัยความผิดปกติของการนอนหลับแห่งชาติของสหรัฐฯ ประเมินว่าชาวอเมริกัน 38,000 คนเสียชีวิตทุกปีด้วยโรคหัวใจที่แย่ลงจากภาวะหยุดหายใจขณะหลับ



นอกจากนี้ยังมีหลักฐานที่เพิ่มขึ้นว่าภาวะนี้ส่งผลต่อการเผาผลาญกลูโคสและส่งเสริมการดื้อต่ออินซูลิน ซึ่งนำไปสู่โรคเบาหวานประเภท 2 และกระตุ้นให้น้ำหนักเพิ่มขึ้น