สัตว์กินเนื้อขนาดใหญ่มักจะไวต่อการเปลี่ยนแปลงของระบบนิเวศ เนื่องจากอาหารเฉพาะทางและตำแหน่งบนสุดของพีระมิดทางโภชนาการนั้นสัมพันธ์กับขนาดประชากรที่เล็ก ด้วยเหตุนี้ จึง มีการรายงานความหลากหลายทางพันธุกรรมต่ำ ในระดับจีโนมทั้งหมดสำหรับแมวโตทุกสายพันธุ์ รวมถึงเสือดาวที่กระจายอยู่ทั่วไป อย่างไรก็ตาม การวิเคราะห์ เสือดาวทั้งจีโนมก่อนหน้านี้ทั้งหมดอิงจากเสือดาวอามูร์ตะวันออกไกลที่อาศัยอยู่ที่ปลายสุดของการกระจายพันธุ์ ความรู้ทั่วไปเกี่ยวกับเสือดาว ดังนั้นจึงไม่จำเป็นต้องเป็นตัวแทนของทั้งสปีชีส์ เราจัดลำดับจีโนมของเสือดาวแอฟริกันทั้งหมด 53 ตัว เป็นที่น่าประหลาดใจที่เราพบว่าความหลากหลายทางจีโนมของเสือดาวแอฟริกานั้นสูงกว่าแมวใหญ่ชนิดอื่นๆ ถึง 2 ถึง 5 เท่า รวมถึงเสือดาวอามูร์ ซึ่งน่าจะเป็นเพราะเสือดาวอามูร์สูงเป็นพิเศษขนาดประชากรที่มีประสิทธิภาพดูแลโดยเสือดาวแอฟริกันตลอดสมัยไพลสโตซีน นอกจากนี้ เราตรวจพบการไหลเวียนของยีนอย่างต่อเนื่องและความแตกต่างของประชากรที่ต่ำมากภายในเสือดาวแอฟริกันเมื่อเทียบกับเสือดาวตัวอื่น